门下平章事、河东节度使，用国昌为雁门以北行营节度使。十月，国昌死。

十一月，派其弟克修进攻昭义孟方立，夺取泽、潞二州。方立退到山东，以邢、氵名、磁三州自称昭义军。黄巢南走至蔡州，秦宗权投降，遂进攻陈州。四年(884)，克用率兵五万救陈州，出天井关，借道河阳，诸葛爽不许，只得从河中渡河。四月，在太康打败尚让军，又在西华打败黄邺军。巢军且走且战，至中牟，临河未渡，李克用追兵赶上，巢军惊溃。巢军退到封丘，又被克用击败，黄巢慌忙退走，克用猛追，一日夜追赶二百里，至冤朐，未能追上只得回师。

克用军路过汴州，在封禅寺休息，朱全忠在上源驿设宴招待克用。夜，喝完酒，克用醉卧时，伏兵齐发，大火烧起，侍者郭景铢把烛吹灭，将克用藏在床下，用水冲脸使其酒醒后告诉他大难临头。恰好天下大雨使大火熄灭，克用和随从薛铁山、贺回鹘等人乘电光，用绳子拴住人，从尉氏门墙上放下去回到军中。七月，回到太原，把这事告到京城，请朝廷派兵攻汴，并叫弟弟克修率兵万人在河中等待。僖宗出面和解，因破巢有功，封克用为陇西郡王。

光启元年(885)，河中王重荣与宦官田令孜有矛盾，迁移王重荣镇兖州，任命定州王处存为河中节度使，下诏命李克用调兵保护王处存赴镇。重荣使人欺骗克用说“：天子下诏给重荣，等李克用至，与处存一齐杀掉。”并造假诏书给李克用看，说：“这都是朱全忠的计谋。”克用相信了，八次上表请求讨伐朱全忠，僖宗不许，克用大怒。

重荣既不肯迁移，僖宗派。。州朱玫、凤翔李昌符去讨伐。克用反而派兵帮助王重荣，在沙苑打败朱玫，进攻京城，纵火抢掠。唐天子出居兴元，克用退兵住河中。朱玫反而派兵追赶唐天子，没有赶上，遇襄王，迫他称帝，兵驻凤翔。僖宗认识到只有李克用能打败朱玫，可是无法调动他，想到当初在长安击败黄巢时，天下兵马都监杨复恭与克用关系好，于是派谏议大夫刘崇望下诏书给李克用，说明是杨复恭的意思，请他进兵讨伐朱玫等。克用假意答应而不肯行动。

第二年，孟方立死，弟迁立。大顺元年(890)，克用击破孟迁，夺取邢、氵名、磁三州，派安金俊到云州攻赫连铎。幽州李匡威救铎，在蔚州大败安金俊。于是匡威、铎及朱全忠都请求朝廷乘机讨伐李克用。昭宗认为克用破巢功高不可伐，就叫台、省四品以上官商议此事，多数大臣认为不可伐。宰相张浚独以沙陀逼僖宗逃到兴元，罪该杀，应当讨伐。军容使杨复恭与克用友善，亦极力劝谏，认为不可伐，昭宗很同意，就下诏书劝谕朱全忠等人。全忠背地里重赂张浚，使他坚持要求讨伐，昭宗不得已，用张浚为太原四面行营兵马都统，韩建为副使。

当时，潞州冯霸叛降归附梁，梁派葛从周进驻潞州。唐派京兆尹孙揆为昭义军节度使，克用派李存孝在长子捉住孙揆，又派康君立攻夺潞州。十一月，张浚在阴地被李克用打得三战三败，张浚、韩建逃回。克用军在晋、绛、河中大肆抢掠，赤地千里。克用上表自诉，词语傲慢带有侮辱性，唐天子表示歉疚，下诏好言抚慰。